Curso prático de Bioinformática e Biotecnologia aplicadas ao diagnóstico e tratamento de doenças humanas.

CARGA HORÁRIA: 80 horas

Nº DE CRÉDITOS: 5

EMENTA

OBJETIVOS

• fornecer uma visão geral de diferentes bancos de dados biológicos
• explorar a estrutura 3D de uma proteína usando PyMOL
• aplicar ferramentas de bioinformática voltadas à análise de proteínas
• aplicar a bioinformática estrutural na identificação das conformações mais estáveis de uma proteína-alvo
• identificar motivos e padrões em seqüências proteicas
• analisar interações proteína-proteína e a susceptibilidade a doenças humanas
• identificar regiões polimórficas em proteínas de interesse médico e farmacológico
• “desenhar” peptídeos moduladores da expressão proteica
• identificar níveis de pressão evolutiva em resíduos localizados nas regiões de hot spots

CONTEÚDO PROGRAMÁTICO

1) Conceitos básicos aplicados às macromoléculas e à bioinformática estrutural.

2) Uso do software de visualização PyMOL.

3) Uso da bioinformática estrutural na determinação da estrutura 3D de proteínas.

4) Inferências funcionais baseadas na determinação de motivos proteicos.

5) Identificação estrutural de polimorfismos genéticos a nível proteico e doenças.

6) Abordagens da biologia computacional na interação proteína-proteína como diagnóstico e tratamento de doenças [1].

7) Desenho racional de peptídeos moduladores [2].

8) Apresentação de seminário/projeto.

REFERÊNCIAS

[1]       K. Silva, Hot spots and single nucleotide polymorphisms on the interaction interface of RAD51 and p53 complex, J Tre Bio Res. 1 (2018) 1–5. doi:10.15761/JTBR.1000104.

[2]       J.S. de Curcio, R.M. Lima, L.N. Oliveira, M.G. Silva, A.M. Barbosa, L.C. Silva, T.G. Santos, I.P. Tannous, K.S.F. Silva, Structure-based design of TFF3-PAR2 inhibitor peptides as a promising new therapeutic approach for endometriosis patients, M J Gyne. 03 (2018) 06.

[3] Introduction to bioinformatics. Arthur Lesk. 2008. Oxford University Press, USA.